三分钟学会的 2 个文献管理策略与 6 个实用工具

作为新人,很多人初始踏入学术界的第一步,是从海量阅读文献开始。我们面对需要深入理解的科学问题,可能是考研面试时跟老板套磁的需求,可能是为了自己课题的推进需要,可能是为了标书准备的研究基础,在对数据库的文献进行精准挖掘之后,如何将这些文献资源精炼并内化成自己的知识图谱,这是必要的学术技能。


一嘉医课(J-Academy)科研专栏,今天和大家分享2个文献管理策略、6个实用工具,希望助各位有更实用、轻松的科研技能。

 

文献管理策略一

搭建知识框架,完善文献存储

很多教导人改善拖延症的视频都会讲述需要在开始工作时保持周围环境的整洁有序,文献管理也是同样的道理。

我们总是会下一大堆的文献,保存文件时没有及时修改文献的名称与信息,随意的保存在电脑桌面或者某个再也想不起来的文件夹,没有建立自己的文献库,既不能体现工作量也不能有效吸收文献的营养,好像干了活又好像没干一样,好像读了文献又好像没读,是不是经常这样呢?


拖延症就像是你在面对困难的实验,假如你每天都要吃一只青蛙,这让你痛苦难耐,那当你拖延到第二天时你需要考虑的是你是要吃掉昨天和今天两只青蛙里较小的那只。但是,当拖延到月末的时候,则是需要考虑吃掉30只青蛙。其痛苦简直不忍目睹。

 

整理文献也是如此,因此,建议各位初入文献管理门的同学,注意以下几个技能的应用:


1. 总览全文,标识重点

 

我们在刚开始整理文献的时候就做好这样的标识与笔记,记录下文献发表的时间,期刊,重要的作者,通讯单位等(看个人需要),包括其他的文献补充文件,代码和数据保存的位置,这样对每一篇文献会有初步的总览认知,像一个小仓库一样分门别类的标注好这些信息,不用在之后再一次次的查找或者是修改这些不会改变的内容。


2. 提取关键词,关注知识框架

 

我们在对某一类相关的文献在初步阅读和查阅的时候,应该注重关键词以及摘要里的主要内容,并以此进行文献的归类。

 

这样的整理工作毫无疑问是非常费时的,但这样亦帮助大家可以根据自己知识图谱的关键节点并对其进行梳理和总结,搭建属于自己的知识框架。


3. 梳理文献库,重塑认知

 

正所谓工欲善其事,必先利其器。对每一篇专业文献进行详实的梳理与管理,确实需要你花费一定的时间与精力整理文献内的信息。


一开始可能会让你觉得过程冗余,甚至进展缓慢。但是这些工作会是未来我们研究工作的重要奠基石,通过这一点一滴的积累,都会在你意想不到领域的给你助力。梳理文献库,也是建立与重塑自己认知的过程。

 

文献管理策略二

通过精读,实现知识交互,保障知识迭代

在完成上述内容时,恭喜你已经初步搭建了自己知识图谱的骨架,那我们接下来要做的事情是在原先的基础上继续填满骨血,让你的知识树逐渐长大丰满。

 

除了继续保持上述填充知识的方式之外,我们还需要实时保证知识的有效迭代,对原先知识树内的枝丫进行修剪与添加,实现交互式的知识更迭。我们上一篇关于文献检索的文章,对延伸搜索和建立知识树提出了一些建议,各位亦可回顾查看


在知识积累的过程中,认知是需要进行反复迭代修改的。与导师或者其他的前辈进行交流之后的认知,这些认知笔记也需要被标注到已经阅读的文献中,对相应的笔记进行管理和完善,在下一次进行查阅和学习文献的时候就会快领悟到上一次读阅读时的思考逻辑,从而加深记忆与对知识要点的理解。


我们接下来,和大家分享几个文献管理工具以及他们如何组合利用,可以帮助大家提升文献管理能力。

 

文献管理工具一

PPT+Excel+Onenote

这一套常用的office办公软件小组只能说必须是YYDS!


在还没有现在如此发达的文献管理工具和笔记管理工具之前,他们是办公软件界的鼻祖。时至今日,还是有很多老师在联合使用这些办公工具进行文献和笔记管理。


PPT:主要用于摘录和整理文献主要信息和文献摘要内关于研究内容部分的标注,将关注的内容相关的文献整理在一个PPT内方便进行集中的内容查阅。

 

Excel:用于对所关注文献建立列表或文献库,记录文献的发表时间,发表期刊和名称,便于对文章的内容进行总览查阅。


Onenote:导入图片或是pdf后,可对文献进行标注并补充笔记,并可用于多平台同步笔记,电脑记录的笔记可以在手机查阅,并可与导师或者小组成员共同分享小组权限一起学习成长。

 

文献管理工具二

Endnote

老牌文献管理软件,便于新建文献库,可以对文献数据库进行在线检索并导入相应的文献,还可以进行整体的文献库迁移,常用于论文写作时插入引文等。

 

在word等软件具有相应的插件,可灵活设置插入引用文献的格式。写过毕业论文的都知道,用过的都说好,就是插入引文之后有点难调论文字符的格式。

 

文献管理工具三

Zetero

对初级用户来说,zetero未必是最优选择,但是随着研究的深入,它的优势会逐渐展现,尤其是具备一定编程理念和能力的科研人员,zetero 的开放性可能会让经常吐槽其他软件的你耳目一新。总结下来,zetero 有以下一些使用优点[1]


  • 软件本身完全免费并且开源,不造成任何盗版风险;

  • 注册后包括 300M 空间同步,但支持 WebDAV 同步,例如 Dropbox 和坚果云等;

  • 官方的反馈论坛比较活跃,有问题可以通过搜索或提问快速得到反馈;

  • 从网站和期刊文章等提取保存出版物数据检索;

  • 拖入 PDF 文件时,数据识别准确率高;

  • 可以和 Word,LibreOffice 集成,方便文献进一步的使用管理;

  • 由于其开源特点,因此有非常强大的第三方插件系统;

  • 每个条目下可以添加任意数量和格式的附件。

 

图1. Zetero 的运行界面(图片来源:https://www.zotero.org/)

 

在使用时将文献保存或导入zetero中,建立相应的文献库,并可对文献库打上相应的标签进行文献分类。同时可以通过提取文献的主要内容转换成markdown文档,解放双手实现输出自由,不再需要手动输入、保存或修改文献核心内容的提取。

 

此外,zetero还可以将pdf内标注的文献笔记提取成markdown文档,不用打开文献就可以看到标注的内容,省时又省力。

 

文献管理工具四

Obsidian

Zetero与Obsidian联用,是目前比较高效的文献管理方式之一。

 

图2. Obsidian 有专门的中文教程和论坛(图片来源:https://publish.obsidian.md/chinesehelp/)

 

通过与zetero联用,Obsidian可以编辑或修改提取成功的markdown文档笔记,我们可以梳理阅读过的文献和文献笔记,通过建立“双向链接”实现“块引用”,帮助构建和巩固个人知识图谱及有效知识迭代,并且这一软件承诺对个人使用者永久免费。

 

小结

俗话说,书读百遍其义自见。科研文献由于其专业性,除了某领域的研究人员,学生或者是从事相关领域的工作人员之外,其内容上已经有一定的认知门槛,更别提是否存在一种通用的阅读文献的方式来理解和学习海量文献。目前大家常用于文献管理与文献笔记管理软件其实有很多种,这里只是推荐了几种常见并易于上手的软件,什么样的软件符合大家的文献管理使用需求,并且未来可以被大家熟练掌握使用,才是真正的好方法。

 

另一方面,大家的导师或者师兄师姐都是积累了一定的阅读量与阅读时间后才能达到比较熟练的阅读现状,实现高效的勤奋需要大量的付出与平凡的努力。

 

首先,我们需要明确的是调整好自己的心态,放弃掉畏难情绪,不需要想到有厚厚一沓文献需要查阅就心生畏惧,要知道你读的每一句文献哪怕你很难记住内容,这些也会默默的影响你的知识树,当你抱着积极的态度去迎接和展开科研工作,会更容易保持热爱的态度。其次,做好阅读文献的准备,比如学习我们的文献管理策略和相关文献管理工具的使用,工欲善其事必先利其器,掌握正确的文献管理和学习文献的方法,保持正确的努力方向,会更容易让人事半功倍。

 

最后也是最重要的一点就是,阅读没有捷径,踏踏实实保持努力就好。



一嘉医课科研专栏







参考文献

[1] https://sspai.com/post/56724



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